Por la ubicación del pueblo de Ixtenco a escasos ocho kilómetros al sur de la ciudad de Huamantla, es probable que desde su fundación, a mediados del siglo XVI, éste se encontrara sujeto, primero al monasterio de la orden franciscana y después a la parroquia de San Luis Huamantla siendo los frailes franciscanos los encargados de realizar la evangelización y conversión de los indios al catolicismo.
La conformación de la parroquia de San Juan Bautista se realizó a mediados del siglo XVII, período que coincide con la terminación de la construcción del templo que hasta la fecha tiene dedicado el santo patrono del lugar.
La copia de un documento expedido por el Juez Gobernador Don Jacinto Calcehual en el año de 1552, otorga las mercedes a Don diego Miguel para que resguarde y defienda los barrios de san Miguel Tesmola, San Juan y todos los demás barrios en que se ubiquen los cinco casiques del pueblo de Ixtenco (Exp. 3, f.1). Para 1640 otro documento relacionado con la posesión de tierras hace mención del barrio de Santiago (Exp. 15, f. 1)
Hasta el momento se desconoce con precisión en que período surgieron los barrios. Se sabe por medio del libro de actas de la cofradía de San Juan Bautista, que para el año de 1734, los barrios del pueblo aportaron una cooperación de $107.00, sin embargo no hace referencia a los nombres específicos de los barrios.. Trece años después, en el año de 1747, se registra una cooperación de $30.00 que fue otorgada por los vecinos del barrio de San Juan, siendo esta la primera referencia que existe para un barrio (Libro de Acta de la Cofradía de San Juan Bautista ).
Para el año de 1750, Trautmann (1981:93) menciona ya la existencia del barrio de la Resurrección en Ixtenco. También considera que hubo diferentes fases de expansión que dio lugar a la formación de agregados de los barrios que recibieron el nombre de un barrio ya existente, pero con la denominación de la unidad primera o segunda (Ibid., 1981:92).
Es para el año de 1852 cuando en uno de los libros de la cofradía del Santo Patrono San Juan Bautista, mensiona la existencia en el barrio de San Antonio de un mayordomo primero con sus respectivos contribuyentes pertenecientes a medio barrio y un mayordomo segundo, con un listado de colaboradores del otro medio barrio. La presencia de un mayordomo primero y un mayordomo segundo que veneraban al mismo santo, suponemos que fue el precedente para la división dual de los barrios tal y como ahora están conformados.
Actualmente el pueblo de Ixtenco se encuentra dividido en nueve barrios, estos son: San Antonio primero y San Antonio segundo; San Juan primero y San Juan segundo; San Gabriel primero y san Gabriel segundo; La Resurrección primero y la Resurrección segundo y barrio de Santiago. Esta división de los barrios aunque más de las veces responde a fines socioreligiosos, en ocasiones, esta estructura es administrativa y organizativa de para facilitar el desarrollo de las actividades en conjunto con las autoridades civiles del municipio y al igual que las autoridades socioreligiosas de los barrios.